牡丹江医学院学报 2013年 第34卷 第6期 ・1・ JOURNAL OF MUDANJIANG MEDICAL UNIVERSITY Vo1.34 NO.6 2013 宁夏滩羊KAP1.1基因多态性及其与二毛裘皮重要性状关系的研究 贾 桦 杨丽娟 李爱华 张蕊 陈志强 何立荣 赵万余 银川 银川 750004; I (1.宁夏医科大学基础医学院人体解剖与组织胚胎学系 宁夏2.宁夏大学生命科学院;3.宁夏大学饲料工程技术研究中心 宁夏750021) 【摘要】 目的:研究宁夏滩羊KAP1.1基因的遗传多态性及其多态位点与滩羊二毛毛股弯曲数、纤维直径及毛股自然长度 的关系,寻找可用于辅助选择的分子标记,为下一步分子育种提供理论依据。方法:采用PCR—SSCP技术研究了261只滩羔 羊KAP1.1基因的多态性,利用DPS7.05软件分析了2个多态位点不同基因型裘皮性状的最小二乘均值(LSM),并进行了多 重比较。结果:发现KAP1.1基因有两个突变位点sl和s2,其中s1位点有3个基因型,s2位点有5个基因型。在二毛裘皮毛 股弯曲数性状上,s1一从的LSM高于S1一AB、S1一BB,但三种基因型阃无显著差异(P>0.05),S2一AB的LSM高于s2一 AA、s2一BB、s2一AC、s2一DD,但五种基因型间无显著差异(P>0.05);在毛股自然长度性状上,s1一AB的LSM显著高于s1 BB(P<0.05),s2一AC基因型的LSM板显著高于s2一BB(P<0.O1);在毛纤维细度性状上,S1一AA的LSM低于S1一AB、 S1一BB,但三种基因型阃无显著差异(P>0.05)。结论:本研究发现了宁夏滩羊KAP1.1基因的两个多肽位点s1和s2,其中 s1位点有3个基因型,而s2位点有5个基因型,处于高度多态(PIC=0.7078)和高度杂合(h=0.7078),该位点上遗传多样性 很丰富,在品系培育上选择潜力很大;S1位点的AB基因型和s2位点的AC基因型都与滩羊二毛皮的毛股自然长度有明显关 系,可作为分子标记用于二毛裘皮较长毛股自然长度潍羊品系定向选育。 【关键词】滩羊;KAP1.1;PCR—SSCP;裘皮性状 【中图分类号】R32【文献标识码】A THE S彻Y oN KAP1.11 GENE PoLY]MoR唧BETⅥ EN THE GENE PoYYMo删SM AND RELATIoNSHIP ISM AND LAM口E| INPoRTANT FUR TRAITS oF NINGXIA TAN SHEEP Jia Hua et al (Department of Anmomy,Histology and Embryology,Basic Medical College,Ningxia Medical University 750004,China) [Abstract] Objective:We study the polymorphism of Ningxia Tan KAP1.1 gene and the relationship between the gene polymo ̄ phism and fur important traits of lamb,including wool fiber diameter,the number of bending and the n ̄ural length of wool stocks in OMer to discover molecular—assisted selection mark for moleculr abreeding in het following work.Methmls:PCR—SSCP technique was used to analyse KAP1.1 gene polymorphism of 261 lambs.Then,software DPS7.05 was used to analyse the least squares mean (LSM)offur traits in two diferent genotypes,and multiple comparisons ofthem ere carried out.Results:We found hatt KAP1.1 gene has S1 and s2 two mutations,in which S1 locus has three genotypes,and s2 locus has five genotypes.In number of bending of wool stcks traits,the LSM of S1一AA is hiogher than S1一AB and S1一BB,but there was no signiifcant diference among the three geno- types(P>0.05);The LsM of s2一ABis higherthan s2一AA,s2一BB,s2一ACand s2一DD,buttherewas no sinigifcant difer- ence among the ifve kinds ofgenotypes(P>0.05).In naturla length ofwool stckso traits,the LSM ofS1一AB was sinigifcantly hih-g er han S1一BB(P<0.05),and tthe ISM of S2一AC was signiifcantly higher than S2一BB(P<0.O1).In the wool iferb ifneness traits,the LSM of S1一AA is lower hatn S1一AB and S1一BB,but no sinigfcant diference was among three genotypes(P>0.05). Conclusion:KAP1.1 gene in Ningxia Tan sheep has two peptides S1 and s2,in which S1 lcus haos three genotypes,and s2 site has ifve genotypes,while s2 site is higMy polymorphic(PIC:0.7078)and hihlgy heterozygous(h=0.7078),in which genetic diver- 【基金项目】863计划(2008AA101001);国家自然科学基金资助项目(30760175) 【作者简介】 贾桦(1981一),女,讲师,博士,主要从事基础教学工作。 通讯作者:李爱华(1959一),女,研究员,硕士,主要从事动物营养与饲料科学方向研究。 牡丹江医学院学报 2013年 第34卷 第6期 ・2・ JOURNAL OF MUDANJIANG MEDICAL UNIVERSⅡY V0L 34 NO.6 2013 sity is very rich and conducive to breed new strain;AB genotype with SI site and AC genotype with s2 site both are clearly related to the natural length of wool stocks in Tan sheep,and the two sites Can be used as molecular markers to breed Tan sheep strain with higher natural length ofwool stocks. [Key words]Tan sheep;KAP1.1;PCR—SSCP;fur traits 滩羊主要分布在宁夏,辐射甘肃、内蒙、陕西等狭窄生 子标记方法来研究其与羊毛经济性状的关系。本研究利用 态区的干旱半荒漠地区,属国家农业部重点保护的地方优良 PCR—SSCP技术选取羊毛纤维结构蛋白KAP1.1基因作为 品种之一,属我国特有的肉毛兼用绵羊品种。滩羊二毛皮产 候选基因来研究其与滩羊裘皮品质性状的关系,通过发现的 业在带动宁夏回族自治区社会效益和经济效益方面起着巨 多态位点,运用最小二乘均值(LSM)分析各多态位点与滩羊 大的作用。因此,在基因水平上研究滩羊的遗传多态性对于 毛股弯曲数、纤维直径及毛股自然长度之间的关系,以达到 宁夏滩羊品种的改良具有积极的推动作用。角蛋白中间丝 准确、有效选择标记的目的,为改善滩羊的裘皮品质性状的 (keratin intermediate filament,KRT—IF)和角蛋白辅助蛋白 早期标记辅助选择提供理论依据和技术贮备。 (keratin—associated proteins,KAPs)是羊毛的主要结构蛋白, 1材料与方法 其中IF有两个家族,即酸性(I型)和碱性(Ⅱ型)角蛋白。 1.1材料(1)样本采集:本试验所用261只二毛羔羊的血 角蛋白辅助蛋白(KAP)包括三类:第一类为高甘氨酸酪氨酸 样分别采自宁夏朔牧盐池滩羊繁育有限公司(100只)和宁 蛋白(hi【gh glycine tyrsine KAPs),由KAP6.n多基因家族、 夏盐池滩羊选育场(161只)。采取静脉采血法,每只羔羊抽 KAP7、KAP8、KAP18~22所编码;第二类为高硫角蛋白辅助 取5mL于装有EDTA的离心管中(已灭菌),冰盒运输,一 蛋白(high sulfur KAPs),由KAP1.n、KAP2.n、KAP3.n、 20 ̄C保存,用于基因多态性分析。采取血样的同时采集相应 KAP10~16等23个家族编码,其中,KAP1(高硫B2)这个家 个体肩部毛样,用于毛股弯曲度、毛股自然长度及毛纤维细 族中的三个成员KAP1.1、KAP1.2、KAP1.3已得到蛋白质序 度的分析。(2)引物设计:根据GenBank报道的绵羊KAP1. 列,其长度分别为171、156和151个氨基酸,平均半胱氨酸 1基因的序列(L33886.1 GI:499872),利用Primer 5.0软件 的含量为22 mo1%…;第三类是超高硫角蛋白辅助蛋白(ul— 设计该基因两对引物sl和s2.(表1),引物序列由上海生物 rta highsulfur KAPs),由KAP4.n、KAP5.n、KAP9、KAP17编 工程技术服务有限公司合成。(3)主要试剂与仪器:Taq酶、 码 。根据国内外学者的研究,KAP基因与羊毛品质存在 dNTP购于北京全式金生物技术有限公司;BssrI限制性内切 相关性 J。近年来,对绵羊KAP基因的研究已有众多报道, 酶购于Promega公司。主要仪器有PCR仪(S1000TM Ther- 一些学者利用微卫星分子标记对绵羊的遗传多样性和经济 mal Cycler,美国Bio—Rad公司)、电泳仪(PowerPacTM Bas- 性状间的关系进行了研究,并找到了与羊毛经济性状连锁的 ic,美国Bio—Rad公司)及凝胶电泳成像系统(Universla QTL_4 J。还有一些学者利用PCR—RFLP、PCR—SSCP等分 Hood II,美国Bio—Rad公司)等。 表l引物序列及退火温度 引物名称 引物序列(5 一3 ) 扩增片段长度 退火温度/℃ Primer nalne Primer sequence(5 一j ) Length of amplification products Annealing temperature 5 ACCTGTGGCTCCAGTCCCT 3 Sl 196 62.5℃ 5 TGCCACAGCCCGTCTCACA 3 5 TGC I’GCCAGCTG IIACTATGCC 3 s2 190 59.8℃ 5 GGTITGC,rIfrGCTYCCCCCT 3 1.2试验方法基因组DNA的提取,血液中的基因组DNA 聚丙烯凝胶210 V电压下4min,后80V电压下,4 ̄C电泳 提取参照《分子克隆实验指南》中提供的酚:氯仿提取法。 200min,银染显色。用凝胶成像系统照相、分析、判定各种基 1.2.2 PCR扩增反应体系总体积为25 :10×Buffer 2. 因型。 5 L,dNTP(2.5 mmol/L)2.Og&,Taq DNA聚合酶(2.5U/I ̄L) 1.2.4羊毛品质分析利用羊毛测定仪测定羊毛的长度、 0.3 ,上下游引物(10 pmol/p,L)各0.5 l,模板DNA(50 nS/ 弯曲数、细度。 IxL)1.0p,L,ddH2018.2 L。反应条件为:95℃预变性3min; 1.2.5数据统计 94℃变性30s;退火30s,72℃延伸30s,35个循环;后72℃延 (1)基因频率是指一个群体中某一基因对等位基因的相 伸5min,4 ̄C保存。 对比率。 1.2.3 SSCP分析取PCR产物2.0uL加入5pLL的变性上 P =[2(ii)+( 。)+( )+……( )]/2n (1— 样缓冲液,98 ̄C变性10 min,立即冰浴5min。12%的非变性 1) 牡丹江医学院学报 2013年 第34卷 第6期 一 ・4・ JOURNAL OF MUDANJIANG MEDICAL UNIVERSITY Vo1.34 NO.6 2013 >PIC>0.25为中度多态,PIC<0.25为低度多态。对于一 0.29个,但三种基因型间差异不显著(P>0.05)。AB基因 个群体而言,PIC高、等位基因数目多、杂合度大,则该位点的 型滩羊毛股自然长度LSM为9.33cm,分别高于AA、BB基因 遗传变异性就高,有较大的选择潜力。由表2可知,滩羊s1 型0.18和0.86cm,其中,AB基因型滩羊显著高于(P<0. 位点PIC=0.2298(<0.25),说明该位点处于低度多态,杂合 05)BB基因型滩羊。AA基因型滩羊毛纤维细度的LSM为 度(He=0.2648)较低。s2位点PIC=0.7078(>0.5),说明 36.38urn,分别低于AB、BB基因型0.51UIla和3.08urn,但三 该位点为高度多态,且杂合度(He=0.7078)也较高。s2位 种基因型间差异不显著(P>0.05)。s2位点各基因型与二 点的有效等位基因数(Ne)高于sl位点,前者的遗传变异较 毛裘皮的毛股弯曲数、毛股自然长度及毛纤维细度的最小二 大。由于滩羊群体在s2位点上遗传多样性很丰富,选择潜 乘均值(LSM)和标准差如表4所示,AB基因型滩羊毛股弯 力很大,所以s2位点可以作为宁夏滩羊裘皮品质性状的遗 曲数LSM为6.50,分别高于AA、BB、AC、DD基因型0.4、0. 传多样性分子标记位点。 64、0.43和0.31个,但五种基因型问没有显著差异(P>0. 2.4位点不同基因型与二毛裘皮性状的关联性分析S1位 05)。AC基因型滩羊毛股自然长度LSM为9.77cm,分别高 点各基因型与二毛裘皮的毛股弯曲数、毛股自然长度及毛纤 于AA、AB、BB、DD基因型0.29、0.28、1.22和0.82cm,其中, 维细度的最小二乘均值(ISM)如表3所示,AA基因型滩羊 AC基因型与BB基因型间差异极显著(P<0.01)。 毛股弯曲数LSM为5.93,分别高于AB、BB基因型0.09个和 表3 S1位点不同基因型与裘皮品质性状的关联性分析 位点 基因型 样本量 毛股弯曲数(LMS±SD) 毛股自然长度(LMS±SD) 3讨论 的细丝填充在KAP的基质之间,低硫角蛋白家族在羊毛纤 本研究发现了宁夏滩羊KAP1.1基因的两个多肽位点 维的角蛋白中间丝内部表达,其余家族在羊毛纤维的基质中 s1和s2,其中sl位点有3个基因型,s2位点有5个基因型, 表达(朱学骏等,2001) J。而角蛋白及亚家族编码基因存 且s1位点的AB基因型和s2位点的AC基因型都与滩羊二 在的多个(SNP)突变与羊毛性状(细度、强度、弹性和弯曲度 毛皮的毛股自然长度有明显关系,可作为分子标记用于二毛 等)存在相关关系 。研究发现在KAP1.1、KAP1.3基因编 裘皮毛股自然长度较长的滩羊品系定向选育。该研究为今 码区发现了多个SNP位点(Itenge—Mweza等,2007) ,本 后长毛股品系的二毛羔羊选育找到了有效的分子标记,但毛 研究以KAP1.1为候选基因研究其多个SNP位点与宁夏滩 股长度作为数量性状,是由多基因和多因素所控制和影响 羊二毛裘皮品质性状(毛股弯曲数、纤维直径及毛股自然长 的,本研究尚未涉及其它对毛股长度有影响的基因,且本研 度)的关系。刘贵芬等 选择2l号染色体上高硫蛋白家族 究没有发现KAP1.1基因多态性与二毛皮毛股弯数度之间 中KAP1.1与KAP1.3中的部分序列和1号染色体高甘氨酸 有关联,而二毛皮另一重要品质性状是毛股花穗的弯曲数, 一酪氨酸蛋白KAP6.1的外显子进行研究,结果发现KAP1. 通常以弯曲数多而著称。 1与KAP1.3所在区域中位点W08667与羊毛细度相关;本 已有的研究表明,在羊毛纤维发育过程中,角蛋白呈暂 研究表明,s1位点AA基因型所对应的毛纤维细度LSM低 时性和间隔性表达,等量的I型和Ⅱ型角蛋白形成8—10 nln 于AB、BB基因型,但三种基因型间未达到显著差异(P>0. 牡丹江医学院学报 2013年 第34卷 第6期 JOURNAL OF MUDANJIANG MEDICAL UNIVERSITY Vo1.34 NO.6 2013 ・5・ 05)。Ponz等 通过片段定位方法寻找控制羊毛性状的 QTL,利用法国的合成品系INR401对4o个微卫星标记进行 pressed in the hair follicle cortex.Invest.Dermato1.2002,118(2): 226—231. 了分析,结果发现在绵羊第3号、7号、25号染色体上有调控 毛长(SL)的QTL,张亚妮等 叫选择KAP6.1(s1位点)、 KAP1.1(s2位点)和KAP1.3(s3和S4位点)基因进行研究, 3 Ian William P,Ian Robert F.Major genes and QTL influencing wool production and’quality.Genetics Selection Evolution(Supp1.).2005: s97一S107. 4 Jin M,Guo CL,Hu JH,et a1.Correl ̄ion analysis of Economic traits in Liaoning new breed of Cashmere goats using micmsatellite DNA marker.Aeta Genetic Sinica.2006,33:230—235. 发现s2一BB基因型可作为体重和产绒量性状等多性状标记 辅助选择的标记。 本研究结果表明sl位点处于低度多态,s2位点处于高 度多态(PIC=0.7078)和杂合度也较高(h=0.7078),s1一 AB和s2一AC基因型可以作为毛股自然长度性状上的标记 基因型。说明滩羊群体在s2位点上遗传多样性很丰富,选 择潜力很大,s2位点可以作为有效的遗传标记用于宁夏滩羊 裘皮品质性状的遗传多样性分析;S1一AB和s2一AC基因型 可以作为分子标记用于毛股自然长度较长的滩羊二毛裘皮 5朱学骏,陈喜雪,李冠群,等.角蛋白相关遗传性皮肤病基因突变 的研究进展[J].中华皮肤科杂志,2001,34(5):403—404. 6管峰,石国庆,刘守仁,等.角蛋白家族及其对羊毛生长发育的调 控[J].生命的化学,2007,27(1):92—94. 7 henge—Mweza TO,Forrest RH,McKenzie GW,et a1.Polymorphism of the KAP1.1,KAP1.3 and K33 genes in Merino sheep.Mol Cell Probes.2007,21:338—342. 用品系筛选。而与二毛裘皮毛股自然长度相关的其他基因 及与二毛裘皮毛股弯曲度有关的基因还有待于进一步挖掘。 参考文献 1 GongH,ZhouHT,Yu ZD,eta1.Identification ofthe ovine keratin —8刘桂芬,田可川,张恩平,等.优质细毛羊羊毛细度的候选基因分 析[J].遗传,2007,29(1):70—74. 9 Ponz R,Moreno C,Allain D,et a1.Assessment of genetic variation explmned by markers forwool traits in sheep via a segmentmapping印一 pmach.Mamm Gonome.2001,12:569—572. 1O张亚妮,张恩平,吴迪,等.内蒙古绒山羊KAP基因与经济性状 关系的研究[J].畜牧兽医学报,2007,38(5):447—451. associated protein KAP1—2 gene(KRTAP1—2).Experimental Dermatology.2011.20:815—819. 2 Shimomura Y,Aoki N,Rogers M A,et a1.hKAPI.6 and hKAP1.7, Two novel human high sulfurKeratin—-associated——proteins ale ex— 收稿日期:2013—07—25 表皮生长因子酪氨酸激酶抑制剂继发耐药后插入化疗的Ⅱ期临床研究 李大鹏 曹莉莉 冯 军徐红 陶敏李玮 (苏州大学附属第一医院肿瘤科 江苏 苏州 215006) 【摘要】 目的:探讨表皮生长因子酪氨酸激酶抑制剂继发耐药后,化疗插入酪氨酸激酶抑制剂的疗效及安全性。方法:纳 入我中心2011—10—2013—05就诊的表皮生长因子酪氨酸激酶抑制剂继发耐药的晚期肺癌患者,每3周行姑息化疗并第2~ 16d插入酪氨酸激酶抑制剂治疗。每两周期评价近期疗效。治疗前及治疗2~4周期后进行生活质量QLQ—C30问卷调查。 结果:纳入的23例患者中,共有PR 7例(21.9%),SD18例(56.3%),PD7例(21.9%),无惠者获得CR。RR为21.9%,DCR 为78.1%。中位PFS为8.6个月,中位总生存时间(OS)13.6月。生活治疗总分显著提高。躯体功能标化分明显升高(P: 0.002).治疗后呼吸困难较前明显改善(P=0.000)。主要不良反应为白细胞减少、中性粒细胞减少及恶心呕吐。结论:在ED FR—TKI继发耐药后,采用化疗并间隙插入TKI的方法 仍可使患者获得较长的PFS和OS。该部分患者的生活质量仍可获 益,且不良反应在可接受范围内。 【关键词l非小细胞肺癌;表皮生长因子酪氨酸激酶抑帝l剂;耐药;生活质量;生存时间 【中图分类号】R73【文献标识码】A 【作者简介】 李大鹏(1980一),男,主治医师,硕士,主要研究方向为肿瘤综合治疗和生物治疗。 【基金项目】 莫阶平医学基金会临床科研专项资助基金(32o.6753.1225) 通讯作者:李玮(1981一),女,助理研究员,硕士,主要研究方向为肿瘤生物治疗。