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一、核酸及蛋白质常用数据 1．核苷三磷酸的物理常数
分化合物 子量 ATP CTP GTP UTP dATP dCTP dGTP dTTP 507 483 523 484 494 467 507 482 259 271 253 262 259 271 253 267 λmax(pH7.0) 1摩尔溶液（pH7.0）中λmax时的最大吸收值 15400 9000 13700 10000 15200 9300 13700 9600 OD280/OD260 0.15 0.97 0.66 0.38 0.15 0.98 0.66 0.71 2．常用核酸的长度与分子量
核酸 λDNA pBR322 28SrRNA 23SrRNA 18SrRNA 19SrRNA 5SrRNA 核苷酸数 48502（双链环状） 4363（双链） 4800 3700 1900 1700 120 分子量 3.0×107 2.8×106 1.6×106 1.2×106 6.1×105 5.5×105 3.6×104 tRNA（大肠杆菌） 75 2.5×104 3．常用核酸蛋白换算数据
（1）重量换算 1μg=10-6g 1pg=10-12g 1ng=10-9g 1fg=10-15g （2）分光光度换算： 1A260双链DNA=50μg/ml 1A260单链DNA=30μg/ml 1A260单链RNA=40μg/ml （3）DNA摩尔换算： 1μg 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端 1μg pBR322 DNA=0.36pmol 1pmol 1000bp DNA=0.66μg 1pmol pBR322=2.8μg 1kb双链DNA（钠盐）=6.6×105道尔顿 1kb单链DNA（钠盐）=3.3×105道尔顿 1kb单链RNA（钠盐）=3.4×105道尔顿 （4）蛋白摩尔换算： 100pmol分子量100，000蛋白质=10μg 100pmol分子量50，000蛋白质=5μg 100pmol分子量10，000蛋白质=1μg 氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿 （5）蛋白质/DNA换算： 1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7×104MW蛋白质 10，000MW蛋白质=270bp DNA 30，000MW蛋白质=810bp DNA 50，000MW蛋
白质=1.35kb 100，000MW蛋白质=2.7kb DNA
4．常用蛋白质分子量标准参照物
（1）高分子量标准参照 肌球蛋白 肌球蛋白 β-半乳糖甘酶B 磷酸化酶B 牛血清白蛋白 过氧化氢酶` 醛缩酶 分子量 212，000 116，000 97，400 66，200 57，000 40，000 （2）中分子量标准参照 磷酸化酶B 牛血清白蛋白 谷氨酶脱氢酶 卵白蛋白 醛缩酶 碳酸酐酶 大豆脻蛋白酶 抑制剂 溶菌酶 97，400 66，200 55，000 42，700 40，000 （3）低分子量标准参照 碳酸酐酶 大豆脻蛋白酶 抑制剂 马心肌球蛋白 溶菌酶 31，00 21，500 16，900 14，400 31，000 肌球蛋白（F1） 8，100 21，500 肌球蛋白（F2） 6，200 14，400 肌球蛋白（F3） 2，500 5．常用DNA分子量标准参照物
λDNA/HindⅢ λDNA/EcoRⅠ λ/HindⅢ+EcoRⅠ pBR322/HaeⅢ 23130 9416 6557 4361 2322 2027 564 125 21226 7421 5804 5643 4843 3530 21227 5148 4973 4268 3530 2027 1904 1584 1375 974 831 564 125 常用抗生素溶液 587 405 504 458 434 267 234 213 192 184 124 123 104 89 80 64 57 51 21 18 11 7 贮存液a 抗生素 浓度 氨苄青霉素 羧苄青霉素 氯霉素 卡那霉素 链霉素 四环素b 50mg/ml(溶于水) 50mg/ml(溶于水) 34mg/ml(溶于乙醇) 10mg/ml(溶于水) 10mg/ml(溶于水) 5mg/ml(溶于乙醇) 保存条件 -20℃ -20℃ -20℃ -20℃ -20℃ -20℃ 工作浓度 严紧型质粒 20μg/ml 20μg/ml 25μg/ml 10μg/ml 10μg/ml 10μg/ml 松弛型质粒 60μg/ml 60μg/ml 170μg/ml 50μg/ml 50μg/ml 50μg/ml a：以水为溶剂的抗生素贮存液通过0.22μm滤器过滤除菌。以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。 b：镁离子是四环素的拮抗剂，四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基（如LB培养基）。 五、常用贮存液的配制 1．30%丙烯酰胺溶液 【配制方法】 将29g丙烯酰胺和1g N，N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37℃溶解之，补加水至终体积为100ml。
用Nalgene滤器（0.45μm孔径）过滤除菌，查证该溶液的pH值应不大于7.0，置棕色瓶中保存于室温。 【注意】 丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收，其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒，但也应谨慎操作，因为它还可能会含有少量未聚合材料。 一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子，在丙烯酰胺贮存液中加入大约0.2体积的单床混合树脂（MB-1Mallinckrodt），搅拌过夜，然后用Whatman 1号滤纸过滤以纯化之。 在贮存期间，丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。 2．40%丙烯酰胺 【配制方法】 把380g丙烯酰胺（DNA测序级）和20g N，N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理，但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。 【注意】 见上述配制30%丙烯酰胺的说明，40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。 3．放线菌素D溶液 【配制方法】 把20mg放线菌素D溶解于4ml 100%乙醇中，1：10稀释贮存液，用100%乙醇作空白对照读取OD440值。放线菌素D（分子量为1255）纯品在水溶液中的摩尔消化系数为21，900，故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为0.182，放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中，保存于-20℃。 【注意】 放线菌素D是致畸剂和致癌剂，配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操作，而不能在开放在实验桌面上进行，谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。 药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度，这类制品便可用于抑制自身引导作用。 4．0.1mol/L腺苷三磷酸（ATP）溶液 【配制方法】 在0.8ml水中溶解60mg ATP,用0.1mol/L NaOH调至pH值至7.0，用蒸馏水定容1ml，分装成小份保存于-70℃ 5．10mol/L乙酸酰溶液 【配制方法】 把770g乙酸酰溶解于800ml水中，加水定容至1L后过滤除菌。 6．10%过硫酸铵溶液 【配制方法】 把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中，该溶液可在4℃保存数周。 7．BCIP溶液 【配制方法】 把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐（BCIP）溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中，保存于4℃ 8．2×BES缓冲盐溶液 【配制方法】 用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BES[N，N-双（2-羟乙基）-2-氨基乙磺酸]、1.6g NaCl和0.027g Na2HPO4，室温下用HCl调节 该溶液的pH值至6.96、然后加入蒸馏水定容至100ml，用0.22μm滤器过滤除菌，分装成小份，保存于-20℃。 9．1mol/L CaCl2溶液 【配制方法】 在200ml蒸馏水中溶解54g CaCl2·6H2O，用0.22μm滤器过滤除菌，分装成10ml小份贮存于-20℃。 【注意】 制备感受态细胞时，取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml，用Nalgene滤器（0.45μm孔径）过滤除菌，然后骤冷至0℃。 10．2.5mol/L CaCl2溶液 【配制方法】 在20ml蒸馏水中溶解13.5g CaCl2·6H2O，用0.22μm滤器过滤除菌，分装成1ml小份贮存于-20℃。 11．1mol/L二硫苏糖醇（DTT）溶液 【配制方法】 用20ml 0.01mol/L乙酸钠溶液（pH5.2）溶解3.09g DTT，过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。 【注意】 DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。 12．脱氧核苷三磷酸（dNTP）溶液 【配制方法】 把每一种dNTP溶解于水至浓度各为
100mmol/L左右，用微量移液器吸取0.05mol/l Tris碱分别调节 每一dNTP溶液的pH值7.0（用pH试纸检测），把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释，在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度，然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的
dNTP，分装成小份贮存于-70℃。 碱基 A G C T 波长（nm） 259 253 271 260 消化系数（ε）[L/（mol·cm）] 1.54×104 1.37×104 9.10×103 7.40×103 比色杯光径为1cm时,吸光度=εM 13．0.5mol/l EDTA(pH8.0)溶液 【配制方法】 在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二钠（EDTA-Na·2H2O），在磁力搅拌器上剧烈搅拌，用NaOH调节 溶液的pH值至8.0（约需20g NaOH颗粒）然后定容至1L，分装后高压灭菌备用。 【注意】 EDTA二钠盐需加入NaOH将溶液的pH值调至接近8.0，才能完全溶解。 14．溴化乙锭（10mg/ml溶液） 【配制方法】 在100ml水中加入1g溴化乙锭，磁力搅拌数小时以确保其完全溶解，然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中，保存于室温。 【注意】 小心：溴化乙锭是强诱变剂并有中度毒性，使用含有这种染料的溶液时务必戴上手套，称量染料时要戴面罩。 15．2×HEPES缓冲盐溶液 【配制方法】 用总量为90ml的蒸馏水溶解1.6g NaCl、0.074g KCl、0.027g Na2PO4·2H2O、0.2g葡聚糖和1gHEPES，用0.5mol/l NaOH调节 pH值至7.05，再用蒸馏水定容至100ml。用0.22μm滤器过滤除菌，分装成5ml小份，贮存于-20℃。 16．IPTG溶液 【配制方法】 IPTG为异丙基硫代-β-D-半乳糖苷（分子量为238.3），在8ml蒸馏水中溶解2g IPTG后，用蒸馏水定容至10ml，用0.22μm滤器过滤除菌，分装成1ml小份贮存于-20℃。 17．1mol/L乙酸镁溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解214.46g四水乙酸镁，用水定容至1L过滤除菌。 18．1mol/L MgCl2溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解203.4g MgCl2·6H2O，用水定容至1L，分装成小份并高压灭菌备用。 【注意】 MgCl2极易潮解，应选购小瓶（如100g）试剂，启用新瓶后勿长期存放。 19．β-巯基乙醇（BME）溶液 【配制方法】 一般得到的是14.4mol/L溶液，应装在棕色瓶中保存于4℃。 【注意】 BME或含有BME的溶液不能高压处理。 20．NBT溶液 【配制方法】 把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml 70%的二甲基甲酰胺中，保存于4℃。 21．酚/氯仿溶液 【配制方法】 把酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/L Tris·HCl(pH7.6)抽提几次以平衡这一混合物，置棕色玻璃瓶中，上面覆盖等体积的0.01mol/l Tris·HCl(pH7.6)液层，保存于4℃。 【注意】 酚腐蚀性很强，并可引起严重灼伤，操作时应戴手套及防护镜，穿防护服。所有操作均应在化学通风橱中进行。与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗，并用肥皂和水洗涤，忌用乙醇。
22．10mmol/L苯甲基磺酰氟（PMSF）溶液 【配制方法】 用异丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml（10mmol/L），分装成小份贮存于-20℃。如有必要可配成浓度高达17.4mg/ml的贮存液（100mmol/L）。 【注意】 PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤，吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。一旦眼睛或皮肤接触了PMSF，应立即用大量水冲洗之。凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。 PMSF在水溶液中不稳定。应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快，且25℃的失活速率高于4℃。pH值为8.0时，20μmmol/l PMSF水溶液的半寿期大约为85min，这表明将PMSF溶液调节 为碱性（pH>8.6）并在室温放置数小时后，可安全地予以丢弃。 23．磷酸盐缓冲溶液（PBS）溶液 【配制方法】 在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44g Na2HPO4和0.24g KH2PO4,用HCl调节 溶液的pH值至7.4加水定容至1L，在15lbf/in2(1034×105Pa)高压下蒸气灭菌20min。保存于室温。 24．1mol/L乙酸钾（pH7.5）溶液 【配制方法】 将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中，用2mol/L乙酸调节 pH值至7.5后加入纯水定容到1L，保存于-20℃。 25．乙酸钾溶液（用于碱裂解） 【配制方法】 在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml水，即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。 26．3mol/L乙酸钠（pH5.2和pH7.0）溶液 【配制方法】 在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠，用冰乙酸调节 pH值至5.2或用稀乙酸调节 pH值至7.0，加水定容到1L，分装后高压灭菌。 27．5mol/L NaCl溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解292.2g NaCl加水定容至1L，分装后高压灭菌。 28．10%十二烷基硫酸钠（SDS）溶液 【配制方法】 在900ml水中溶解100g电泳级SDS，加热至68℃助溶，加入几滴浓盐酸调节 溶液的pH值至7.2，加水定容至1L，分装备用。 【注意】 SDS的微细晶粒易扩散，因此称量时要戴面罩，称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS，10%SDS溶液无须灭菌。 29．20×SSC溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解175.3g NaCl和88.2g柠檬酸钠，加入数滴10mol/l NaOH溶液调节 pH值至7.0，加水定容至1L，分装后高压灭菌。 30．20×SSPE溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解17.5g NaCl、27.6g NaH2PO4·H2O和7.4g EDTA，用NaOH溶液调节 pH值至7.4（约需6.5ml 10ml/L NaOH），加水定容至1L，分装后高压灭菌。 31．100%三氯乙酸溶液 【配制方法】 在装有500g TCA的瓶中加入227ml水，形成的溶液含有100%（M/V）TCA。 32．1mol/L Tris溶液 【配制方法】 在800ml水中溶解121.91g Tris碱，加入浓HCl调节 pH值至所需值。 pH HCl 7.4 70ml 7.6 60ml 8.0 42ml 应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值，加水定容至1L，分装后高压灭菌。 【注意】 如1mol/L溶液呈现黄色，应予丢弃并置备质量更好的Tris。 尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值，但仍可向大多数厂商购得合适的电极。 Tris溶液的pH值因温度而异，温度每升高1℃，pH值大约降低0.03个单位。例如：0.05mol/L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为9.5、8.9和8.6。 33．Tris缓冲盐溶液（TBS）（25mmol/l Tris） 【配制方法】 在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl和3g Tris碱，加入0.015g酚并
用HCl调至pH值至7.4，用蒸馏水定容至1L，分装后在151bf/in2(1.034×105Pa)高压下蒸汽灭菌20min，于室温保存。 34．X-gal溶液 【配制方法】 X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。用二基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。保存于一玻璃管或聚丙烯管中，装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏，并应贮存于-20℃。X-gal溶液无须过滤除菌。 杂交试验中用于降低背景的封闭剂 试剂 用途 Northern杂交 使用RNA探针的杂交 Denhardt试剂 单拷贝序列的Southern杂交 将DNA固定于尼龙膜上的杂交 Denhardt试剂通常配制50×贮存液，过滤后保存于-20℃。可将该贮存液10倍稀释于预杂交液（常为含有0.5%SDS和100μg/ml经变性被打断的鲑精DNA的6×SSC或6×SSPE）中。50×Denhardt液中含5g聚蔗糖（Ficoll,400型，Pharmacia）、5g聚乙烯吡咯烷酮和5g牛血清白蛋白（组分V”Sigmal），加水至终体积为500ml。 Grunstein-Hogness杂交 Benton-Davis杂交 BLOTTO 除单拷贝序列Southern杂交以外的所有Southern杂交 斑点印迹 1×BLOTT（牛乳转移技术优化液，Bovine Lacto Transfer Technique Optimizer）,是含5%胶脂奶粉和0.02%叠氮钠的水溶液，应保存于4℃。使用前可用预杂交液稀释25倍。BLOTTO不应与高浓度的SDS并用，因为后者会导致牛奶中蛋白质析出。如果杂交背景不合要求，可在杂交液中加入NP-40至终浓度为1%。BLOTTO不能用作Northern杂交的封闭剂，因为这一封闭剂中可能含有RNA酶，其活性之高使人无法接受。 注意：叠氮钠有毒性，取用时需戴手套小心操作。含叠氮钠的溶液应予明确标记。 Southern杂交 肝素 原位杂交 肝素（Sigma H-7005，从猪中提取的二级产品或相当等级的产品）用4×SSPE或4×SSC溶解配制成50mg/ml的浓度，保存于4℃。肝素在含有葡聚糖硫酸酯的杂交液中用作封闭剂的浓度为500μg/ml，在不含葡聚糖硫酸酯的杂交液中的浓度为50μg/ml。 经变性并被打断的鲑精DNA southern和Northern杂交 把鲑鱼精子DNA（Sigma,Ⅲ,盐钠）溶解于水配制成10mg/ml的浓度，必要时于室温磁力搅拌2～4h助溶。把溶液中NaCl的浓度调至0.1mol/L，并用酚和酚/氯仿各抽提一次，回收水相。合DNA溶液快速通17号皮下注射针头12次，以剪切DNA。加入2倍体积用冰预冷的乙醇沉淀DNA。离心回收DNA并重溶于水，配制成10mg/ml的浓度，测定溶液的OD260值并计算出精确的DNA浓度，然后煮沸10min，分装成小份保存于-20℃。使用前置沸水浴中加热5min，然后迅速在冰浴中骤冷。预杂交液中应含有100μg/ml经变性并被打断的鲑鱼精子DNA
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