法律分析：职务犯罪案件中，被害人可以向法院提起民事诉讼，要求赔偿损失。同时，也可以通过调解的方式解决赔偿问题。调解的方式包括人民调解和律师调解，由双方当事人自愿协商达成协议。调解协议可以作为民事判决或裁定的依据。
法律依据：
1.《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十六条：“当事人可以自行和解，也可以申请人民调解、仲裁或者诉讼。”
2.《中华人民共和国刑法》第六十四条：“职务犯罪的被害人，有权向国家提出赔偿请求。当事人自愿可以通过调解、仲裁和诉讼等方式解决赔偿问题。”
3.《最高人民法院关于贯彻执行〈中华人民共和国民事诉讼法〉若干问题的解释》第一百零七条：“离婚案件、侵权责任纠纷案件、建设工程施工合同纠纷案件、劳动争议纠纷案件、合同纠纷案件、债权债务纠纷案件等普通民事案件，可以申请人民调解。”
总结：在职务犯罪案件中，被害人可以申请调解解决赔偿问题。调解协议可以作为民事判决或裁定的依据。
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