重庆重点物资通行证办理流程如下：
一、首先，打开【随申办】APP，点击页面下方的【办事】。
二、然后，进入办事页面，选择【重点物资运输】点击进入。
三、接着，进入重点物资运输页面，点击【重点物资运输车辆通行证申请】。
四、最后，进入重点物资运输车辆通行证申请页面，点击【立即办理】即可。需要特别说明的是，不是所有货运车辆都需要办理通行证，对于运输起讫地两端都不在涉疫地区，或者承运的不是重点物资的车辆，不需要申领、办理和使用通行证。
在符合防疫要求的前提下，各地不得以车辆未持有通行证为由车辆通行，对于持有通行证的车辆，各地应当采取有效措施保障车辆优先快速通行。
法律依据：《中华人民共和国道路交通安全法》第三十九条
机关交通管理部门根据道路和交通流量的具体情况，可以对机动车、非机动车、行人采取疏导、通行、禁止通行等措施。遇有大型群众性活动、大范围施工等情况，需要采取交通的措施，或者作出与公众的道路交通活动直接有关的决定，应当提前向社会公告。
