法律分析：
在公司犯罪调查程序中，调查报告的处理是至关重要的一步。公司应该根据调查报告的内容做出相应的决策，以确保公司合法合规经营。具体处理方式应该根据调查报告的内容和公司情况而定。
法律依据：
1.《中华人民共和国公司法》第四十七条：公司应当建立健全内部管理制度，保证公司合法合规经营。
2.《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百五十六条：机关和检察机关应当对犯罪行为进行认真的调查和审查，收集有关证据和材料。
3.《中华人民共和国刑法》第七十三条：企业单位的刑事责任，依照本法规定追究。
4.《中华人民共和国刑法》第二百六十三条：公司犯罪的刑事责任，可以由公司承担罚款、责令停产、停业，或者吊销执照等。
综上所述，公司在处理犯罪调查报告时，应建立健全的内部管理制度，认真调查和审查犯罪行为，收集有关证据和材料，同时应当按照相关法律规定，对公司犯罪承担刑事责任。
