处理方式如下：
一、一方主张经营该企业的，对企业资产进行评估后，由取得企业一方给予另一方相应的补偿；
二、双方均主张经营该企业的，在双方竞价基础上，由取得企业的一方给予另一方相应的补偿；
三、双方均不愿意经营该企业的，按照《个人独资企业法》等相关规定办理。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第一千零八十七条离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
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